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菲律宾女子大学世界排名20世纪50年代开始，唐长孺痛感敦煌文书及新疆吐鲁番出土文书难以被学界充分利用，多次向国家提出整理相关出土文献的建议。1975年，国务院正式批准成立“吐鲁番出土文书整理组”，由他任组长。年过六旬的唐长孺当年就赴新疆考察，因路途颠簸，右眼视网膜脱落，竟致失明。但他仍带领武大历史系师生，逐一整理、识读近万枚文书残片，考证断代。历时16年，十册释文本《吐鲁番出土文书》出齐。

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